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DNA壓縮的強(qiáng)大工具 - 組蛋白

日期:2024-01-29 14:41:50

你知道嗎?你體內(nèi)的每個細(xì)胞幾乎都有六英尺長的DNA?最大的人類細(xì)胞的直徑僅相當(dāng)于一根頭發(fā)的寬度。這是不是很神奇?你是否想知道為什么所有的DNA都不會在細(xì)胞內(nèi)四處亂竄?是的,答案就是組蛋白。當(dāng)DNA纏繞在組蛋白周圍時,它的長度會縮短至0.09毫米。本文將重點介紹組蛋白的定義,根據(jù)不同功能進(jìn)行分類以及核小體的結(jié)構(gòu)。


1. 組蛋白的定義

組蛋白是指各種簡單的水溶性蛋白,富含堿性氨基酸賴氨酸和精氨酸,與真核染色質(zhì)中的DNA結(jié)合成核小體。它們存在于真核細(xì)胞的細(xì)胞核內(nèi)。它們的功能是將DNA包裝成結(jié)構(gòu)單位,稱為核小體。組蛋白是染色質(zhì)中的主要蛋白質(zhì)。染色質(zhì)是細(xì)胞核內(nèi)DNA和蛋白質(zhì)的組合體。由于DNA纏繞在組蛋白周圍,它們還在基因調(diào)控中發(fā)揮作用。


2. 組蛋白的分類

有五個家族的組蛋白(H1到H5)。根據(jù)不同的功能,它們被分為兩組。一組是核心組蛋白,包括H2A,H2B,H3和H4。另一組是連接組蛋白,包括H1和H5。核心組蛋白形成核小體的中心,因此稱為“核心”。連接組蛋白位于核小體的入口和出口處,將DNA固定在位,因此稱為“連接”。

2.1 核心組蛋白

核心組蛋白包括H2A,H2B,H3和H4,它們都以二聚體的形式存在,這些二聚體非常相似,它們都具有組蛋白折疊結(jié)構(gòu)域:三個α螺旋由兩個環(huán)連在一起。正是這種螺旋結(jié)構(gòu)使得不同的二聚體之間可以相互作用,特別是以頭尾相接的方式(也稱為握手結(jié)構(gòu)),正如圖1所示。由于不同二聚體之間有相互作用的特性,這四個不同的二聚體可以聚集形成一個含八個亞基的核小體。

核心組蛋白H2A/H2B/H3/H4的三維結(jié)構(gòu)

圖1. 核心組蛋白H2A/H2B/H3/H4的三維結(jié)構(gòu)

(圖片來源:維基百科)

2.2 連接組蛋白

除了核心組蛋白,還有另一種類型的組蛋白,被稱為連接組蛋白,包括H1和H5(在鳥類中)。所有多細(xì)胞真核生物中存在的連接組蛋白都是組蛋白家族中最不同的一組,具有眾多細(xì)胞類型和發(fā)育階段特異性的變體。連接組蛋白H1是染色質(zhì)結(jié)構(gòu)的基本組成部分,它將核小體連接成更高階的結(jié)構(gòu)。組蛋白H5的功能與組蛋白H1相似,在某些細(xì)胞中代替H1。連接組蛋白對染色質(zhì)的更高階結(jié)構(gòu)至關(guān)重要,因為它們與核小體間的DNA結(jié)合,并促使單個核小體之間的相互作用。


3. 核小體的結(jié)構(gòu)

如您所知,核心組蛋白形成二聚體和四聚體,二聚體含有兩個組蛋白,四聚體含有四個組蛋白。每個核小體有兩個相同的二聚體,每個二聚體由一個H2A和一個H2B組蛋白組成。這被稱為H2A-H2B二聚體。此外,每個核小體還有一個由兩個H3和兩個H4組蛋白組成的四聚體。這被稱為H3-H4四聚體。然后,這兩個四聚體和DNA形成一個核小體。正如圖2所示。

核小體結(jié)構(gòu)圖

圖2. 核小體結(jié)構(gòu)圖

(圖片來源:維基百科)

一根DNA鏈將繞核心組蛋白纏繞1.65圈。核小體之間的相互作用允許形成更高級別的結(jié)構(gòu)。連接組蛋白H1結(jié)合在DNA的入口和出口處的核小體上,從而將DNA固定在位置上,形成更高級別的結(jié)構(gòu)。這些更高級別的結(jié)構(gòu)可以使染色質(zhì)濃縮到形成染色體的程度。染色體位于細(xì)胞核內(nèi),包含基因。染色體的熟悉形狀是X形。正是組蛋白使得這種熟悉的結(jié)構(gòu)成為可能。

在這里,我們列出了華美生物組蛋白抗體產(chǎn)品的部分內(nèi)容,如表1所示。

表1. The active immune checkpoint proteins from CUSABIO

靶點 貨號 產(chǎn)品名稱 種屬 應(yīng)用范圍
HIST1H1E CSB-PA010380PA25nme1HU HIST1H1E (Ab-25) Antibody Human, Mouse ELISA, WB, IHC, IF, ChIP
HIST1H1D CSB-PA010379PA140nforHU HIST1H1D (Ab-140) Antibody Human, Mouse, Rat ELISA, WB, IHC, IF
HIST1H1C CSB-PA010378PA186nme1HU HIST1H1C (Ab-186) Antibody Human, Mouse, Rat ELISA, WB, IP
HIST1H1C CSB-PA010378OA167ncrHU HIST1H1C (Ab-167) Antibody Human, Mouse, Rat ELISA, WB, IHC, IF
HIST1H1C CSB-PA010378OA96nme1HU HIST1H1C (Ab-96) Antibody Human, Mouse, Rat ELISA, WB, IHC, IF, ChIP
HIST1H1C CSB-PA010378OA109nforHU HIST1H1C (Ab-109) Antibody Human, Rat ELISA, WB, IHC, IF
HIST1H1C CSB-PA010378OA45nme2HU HIST1H1C (Ab-45) Antibody Human, Mouse, Rat ELISA, WB, IHC, ChIP

特別關(guān)注